Aryana Libris

Auteurs : Cornish-Bowden Athel - Jamin Marc - Saks Valdur
Ouvrage : Cinétique Enzymatique
Année : 2004

Lien de téléchargement : Cornish-Bowden_Athel_-_Jamin_Marc_-_Saks_Valdur_-_Cinetique_Enzymatique.zip

Dans le contexte post-génomique actuel, la recherche en biologie doit faire face à de nouveaux défis et étendre ses domaines d’investigation vers des niveaux de complexité croissante. Il s’agit notamment de déterminer la structure et la fonction de toutes les protéines encodées dans les génomes étudiés, de comprendre les processus de contrôle de l’expression différentielle de ces protéines dans les différents types de cellules d’un organisme vivant, de mettre en évidence les interactions protéine/protéine en relation avec leur implication dans les phénomènes biologiques (protéomique) ou encore de décrire de manière quantitative le fonctionnement moléculaire d’un organisme dans ses états normaux et physiopathologiques. Ce dernier domaine d’étude constitue, dans la mouvance scientifique actuelle, l’étude du physiome ou physiologie génomique. Cette physiologie génomique a pour objectif de décrire le fonctionnement des organismes vivants en allant du génome vers le protéome et le métabolome jusqu’à la caractérisation du fonctionnement intégré des cellules, des tissus et des organes. Cette étude de systèmes métaboliques complexes repose sur le développement de modèles compréhensibles des systèmes biologiques par des méthodes de modélisation mathématique, un domaine aujourd’hui en plein essor, et sur l’utilisation de la cinétique enzymatique pour obtenir les données quantitatives nécessaires pour cette analyse. La cinétique enzymatique a pour objectif d’identifier et de décrire les mécanismes de réaction en étudiant leur vitesse et les flux métaboliques. En partant des enzymes isolés et en allant vers des systèmes métaboliques organisés et intégrés, les méthodes de cinétique enzymatique permettent de décrire de manière quantitative les propriétés catalytiques des enzymes et les mécanismes de leur régulation. Historiquement, les lois gouvernant la vitesse des processus chimiques ont été découvertes empiriquement dans le courant du XIXe siècle et les explications théoriques rendant compte des observations phénoménologiques sont apparues au début du XXe siècle, sur la base des découvertes de la physique moléculaire, de la thermodynamique chimique et statistique et de la mécanique quantique. La cinétique enzymatique utilise les théories et les découvertes de la cinétique chimique pour la description et l’étude des mécanismes des réactions catalysées par des enzymes, les catalyseurs biologiques, qui sont essentiellement des protéines comportant des sites actifs catalytiques. Dans les études biochimiques fondamentales, les méthodes cinétiques sont combinées avec des études structurales et des méthodes de biologie moléculaire, telle la mutagenèse dirigée, afin d’aboutir à une description du mécanisme réactionnel au niveau atomique. Ainsi, la cinétique enzymatique est un outil important et nécessaire dans de nombreuses études biochimiques mais sa nature quantitative et sa capacité à prévoir l'évolution d’un processus biochimique au cours du temps, en font également un élément de base de la biotechnologie. La cinétique enzymatique constitue donc une part importante de la culture et de la connaissance biochimique que les étudiants en biologie, quelle que soit leur spécialisation, devraient acquérir au cours de leur cursus. Il existe plusieurs ouvrages classiques de cinétique enzymatique en anglais (SEGEL, CORNISH-BOWDEN, GUTFREUND) qui constituent une source de formation et d’information suffisamment détaillée et complète de ce type d’approche. Toutefois, la situation en langue française est différente. L’excellent ouvrage de J. PELMONT intitulé Enzymes donne une bonne description de l’enzymologie, mais principalement de ses aspects qualitatifs. Le but de notre ouvrage est de fournir un manuel de référence pour la cinétique enzymatique, complémentaire de celui de PELMONT. Dans ce but, nous avons traduit et adapté le livre d’Athel CORNISH-BOWDEN intitulé Fundamentals of Enzyme Kinetics en utilisant le matériel du cours d’enzymologie donné à l’Université Joseph Fourier de Grenoble par Valdur SAKS et Marc JAMIN. Ce livre commence par une description des principes simples de la cinétique chimique et de la thermodynamique et comprend une description détaillée de la cinétique dans des conditions d’état stationnaire pour les enzymes à un ou à plusieurs substrats, des phénomènes d’inhibition et d’activation, de la régulation allostérique et de la coopérativité dans les réactions enzymatiques. Il aborde les systèmes multienzymatiques et l’analyse du contrôle métabolique en présentant une analyse soigneuse des applications pratiques de ces méthodes. Nous espérons que ce nouvel ouvrage comblera le vide existant dans la littérature en langue française et sera utile aussi bien pour les étudiants de licence et de master que pour les chercheurs dans tous les domaines de la biologie. Les auteurs remercient tout particulièrement Léonard CHAVAS qui, au cours de sa maîtrise de biochimie à l'Université Joseph Fourier de Grenoble, a contribué de manière importante à la traduction et à l'adaptation des premiers chapitres de ce livre, ainsi que Madame Simone JERÔME et Monsieur Philippe MOTTET de la Bibliothèque des Sciences de l’Université Liège pour leur aide dans la consultation de documents concernant Victor HENRI. Athel CORNISH-BOWDEN Marc JAMIN Valdur SAKS. ...